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Les champignons saprophytes, dont fait partie le champignon de Paris Agaricus bisporus, se développent sur les feuilles, les bois morts, les cadavres, etc. Ces décomposeurs jouent un rôle essentiel dans l'écologie des milieux forestiers et des prairies. © Bram Herman
Depuis plus de 300 ans, le processus de fructification du champignon de Paris est maîtrisé dans les champignonnières à des fins alimentaires. La production annuelle mondiale dépasse 1.400.000 t dont plus de 100.000 t proviennent de France (essentiellement de la région du Val de Loire). À l'état sauvage, le champignon de Paris est plutôt rare et pousse principalement sur les litièreslitières dans les forêts (surtout de cyprès) et les prairies.
Dans le cadre d'un vaste projet de séquençageséquençage d'une trentaine de génomesgénomes de champignons saprophytessaprophytes, mené aux États-Unis par le Joint Genome Institute, des équipes de l'Inra (MycSA), du CNRS, des universités de Lorraine (IAM) et d'Aix-Marseille (AFMB) ont analysé le génome de deux variétés d'Agaricus bisporus, le champignon de Paris (ou champignon de couche) très proches génétiquement ; l'une poussant dans un désert californien et l'autre utilisée en culture.
Les champignons de Paris sont cultivés dans des caves ou à l'intérieur d'anciennes carrières souterraines. Leur environnement doit être aéré, mais maintenu à une température constante. © I.G. Safonov, Wikimedia common, CC by-sa 3.0
Vers une amélioration génétique des champignons de Paris ?
En comparant le répertoire de gènesgènes de ces agarics avec ceux de plusieurs champignons xylophages (qui dégradent le bois mort), les chercheurs ont mis en évidence différents mécanismes enzymatiquesenzymatiques propres au champignon de Paris. Ces processus spécifiques lui permettent de survivre et de proliférer sur un milieu complexe très riche en acidesacides humiques freinant la croissance de la plupart des autres micro-organismesmicro-organismes. Ces acides s'accumulent dans l'humus des litières forestières, des prairies ou le compostcompost dans les champignonnières, sur lesquels poussent abondamment les champignons de Paris. L'utilisation efficace de cette matièrematière organique nécessite un arsenal d'enzymesenzymes de détoxicationdétoxication et de dégradation particulièrement performant. Ainsi, l'étude révèle, chez le champignon de Paris, l'existence de 24 formes d'une peroxydase (une enzyme permettant l'oxydationoxydation) particulièrement efficace dans la dégradation des acides humiques, là où les champignons xylophagesxylophages n'en présentent qu'une seule.
Ces résultats, publiés dans la revue Pnas, permettent de mieux comprendre comment les champignons décomposeursdécomposeurs du bois et d'humus, en agissant de concert, jouent un rôle écologique majeur et assurent le recyclagerecyclage du carbonecarbone dans l'environnement. Ces travaux confirment également le lien entre la niche écologique de ces champignons et leur patrimoine génétiquegénétique.
Par ailleurs, les scientifiques ont identifié un ensemble de facteurs génétiques contrôlant la croissance et la formation du champignon de Paris. Ouvrant la voie à de nouvelles améliorations génétiques de cette espèceespèce, ces résultats aboutiront à la sélection de nouvelles souches pour la filière agroalimentaire.
par CNRS
le 16 octobre 2012
