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L'équation de Heisenberg est l'équation fondamentale de la mécanique quantique dans la formulation dite de Heisenberg.

En mécanique quantique les grandeurs physiques observables sont quantifiées et sont sous la forme d'un opérateur hermitien  .

Un opérateur particulièrement important est l'opérateur Hamiltonien  défini à partir de l'énergie totale du système physique considéré, comme par exemple celle de l'atome d'hydrogène, d'un électron dans un champ magnétique etc...

L'équation de mouvement d'une grandeur physique du système porte alors sur les opérateurs, elle s'écrit :

 

où   et  est la constante de Planck divisée par .

C'est l'équation de Heisenberg.