Sous les protéinesprotéines situées sous la matrice, la capsidecapside se cache (en orange). Elle est en forme de cônecône, composé de 250 hexamères de 12 pentamères de protéines de capside (CA), soit 110.600 au total. Elle contient le génomegénome du virus sous forme d'ARNARN. Attachée à la capside (boule grise), la cyclophiline est une protéine cellulaire qui permet d'aider le virionvirion à décapsider l'ARN dans le cytoplasmecytoplasme de la cellule.
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