au sommaire
Ensemble des génomes des bactéries colonisant l'organisme d'un animal. On les considère collectivement pour une raison essentiellement pratique. Plutôt que de séquencer successivement les génomes de toutes les espècesespèces bactériennes, on utilise les méthodes de la métagénomiquemétagénomique, applicable à un écosystèmeécosystème complet.
Les bactéries qui vivent en commensalisme avec le corps des animaux y jouent des rôles très importants, notamment pour la digestion et la défense contre les organismes pathogènes.
On estime que les bactéries hébergées par le corps humain sont environ dix fois plus nombreuses que ses propres cellules. L'ensemble de leurs populations forme un écosystème dont on sait peu de choses et qui fait aujourd'hui l'objet d'études.
Le terme "microbiome" désigne l'ensemble des micro-organismes (bactéries, virusvirus, champignonschampignons, et autres micro-êtres) présents dans un environnement spécifique. Dans le contexte humain, il se réfère à tous les micro-organismes présents dans et sur le corps humain. Ceux-ci ne sont pas uniquement des occupants passifs; ils jouent un rôle crucial dans la régulation de nombreux aspects de la santé humaine.
Impact du microbiome sur la santé
Le microbiome influence diverses fonctions corporelles cruciales, dont le métabolismemétabolisme, l'immunitéimmunité et même le comportement. Des études ont montré que les déséquilibres dans le microbiome peuvent être associés à une variété de maladies, y compris certaines formes de cancercancer, d'asthmeasthme, d'obésitéobésité, de maladies neurodégénérativesmaladies neurodégénératives et de troubles gastrogastro-intestinaux.
Rôles du microbiome dans la digestion et l'immunité
Les bactéries du microbiome jouent un rôle essentiel dans la digestion en aidant à décomposer les aliments que le corps humain ne peut pas digérer seul. Elles aident également à synthétiser des vitaminesvitamines importantes comme la vitamine Kvitamine K et certaines vitamines B. En termes d'immunité, le microbiome agit comme une barrière de défense en empêchant la colonisation par des agents pathogènes dangereux et en modulant le système immunitairesystème immunitaire pour répondre de manière appropriée aux menaces.
Techniques d'étude du microbiome
L'avancée des techniques de séquençageséquençage génétiquegénétique et de métagénomique a révolutionné notre compréhension du microbiome. Ces technologies permettent aux scientifiques de séquencer l'ADNADN de tous les organismes présents dans un échantillon sans nécessiter de culture en laboratoire. Cela ouvre de vastes possibilités pour explorer non seulement le rôle des bactéries connues mais aussi de celles qui sont jusqu'à ce jour non cultivables et inexplorées.
Comprendre le microbiome offre des voies potentielles pour de nouvelles thérapiesthérapies. Par exemple, la manipulation du microbiome par des probiotiquesprobiotiques, des prébiotiquesprébiotiques, ou des transplantationstransplantations de microbiotemicrobiote fécal est à l'étude pour traiter des conditions telles que la maladie de Crohnmaladie de Crohn, le syndrome de l'intestin irritablesyndrome de l'intestin irritable, et même certains troubles psychologiques comme la dépression et l'anxiété.
Le microbiome est un écosystème riche et complexe dont l'exploration et la compréhension continuent de s'élargir grâce aux avancées technologiques. Les implications de cette connaissance pour la médecine et la biologie sont vastes, offrant un avenir prometteur pour des traitements personnalisés et plus efficaces qui ciblent le microbiome pour améliorer la santé globale.
