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Dans ce cladogramme, la sélection rouge est paraphylétique car elle n'inclut pas tous les descendants de l'ancêtre commun (E est exclu du groupe). © Quentin Mauguit, Futura-Sciences
Dans la classification des êtres vivants, un groupe ou taxontaxon est dit paraphylétique lorsque qu'il regroupe un ancêtre communancêtre commun avec une partie de ses descendants.
La paraphylie s'oppose ainsi à la monophyliemonophylie et la polyphyliepolyphylie.
Sur le schéma ci-dessous, la sélection en rouge représente un groupe paraphylétique. Les taxons A à E ont un ancêtre commun mais E ne fait pas partie du groupe.