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L'ADN ribosomique, représenté ici sous forme simplifié, est composé, entre autres, de deux ITS. © DR
L'ITS (pour Internal Transcribed Spacer) est une région de l'ADN ribosomique. C'est une région non codante et hautement polymorphe. Pour cette raison, elle est très fréquemment utilisée en biologie cellulaire pour mettre en évidence une différence génétique entre deux espècesespèces, par exemple, particulièrement chez les champignons.
Champ lexical : espaceur interne transcrit | espaceur transcrit interne
Les ITS jouent un rôle crucial dans la biologie moléculaire notamment en raison de leur variabilité génétique. Cette variabilité fait des ITS des marqueurs précieux pour la phylogénétiquephylogénétique et la systématique, permettant de distinguer les organismes au niveau des espèces, genres ou même familles. En examinant les séquences ITS, les chercheurs peuvent reconstituer des relations évolutives entre diverses formes de vie, contribuant ainsi à une meilleure compréhension de la biodiversitébiodiversité et de l'évolution des espècesévolution des espèces.
Utilisation des ITS dans les études de phylogénétique
La phylogénétique s'appuie largement sur l'analyse des ITS pour établir des arbresarbres évolutifs détaillés. Grâce à son taux élevé de polymorphisme, l'ITS peut révéler des variations infimes entre les espèces, ce qui est particulièrement utile pour étudier les espèces proches ou cryptiques, où les différences morphologiques ne sont pas évidentes.
ITS et identification des espèces
En taxonomie, les ITS sont utilisés dans le cadre de l'identification moléculaire des espèces. Les analyses basées sur ces espaces intergéniques offrent un moyen fiable et rapide de déterminer l'identité spécifique des organismes, particulièrement dans les cas où les attributs morphologiques sont insuffisants ou trompeurs.
Applications pratiques des ITS dans divers domaines scientifiques
Outre la taxonomie et la phylogénétique, les ITS ont des applicationsapplications vastes et variées dans plusieurs secteurs de la recherche scientifique et de l'industrie. Parmi celles-ci, nous pouvons citer la médecine, où elles contribuent à l'étude des pathogènespathogènes fongiques et à la mise au point de stratégies de lutte contre les infections fongiques. De plus, dans le domaine de la biotechnologiebiotechnologie, la modification génétique de plantes ou de microbesmicrobes pour la production de substances utilessubstances utiles est souvent guidée par des analyses ITS.
- ÉcologieÉcologie: Les ITS permettent d'étudier la biodiversité fongique dans les écosystèmesécosystèmes, offrant des aperçus sur les interactions écologiques et les fonctions écosystémiques des champignonschampignons.
- Biocontrôle: En identifiant précisément les agents pathogènes, les ITS sont un outil essentiel dans le développement de stratégies de biocontrôle, particulièrement dans l'agricultureagriculture durable.
- Foresterie: Utilisées pour classifier et surveiller la santé des arbres, les ITS aident à gérer les populations d'arbres et à prévenir les maladies fongiquesmaladies fongiques forestières.
Techniques d'analyse des ITS
Pour étudier les régions ITS, les scientifiques emploient diverses techniques de biologie moléculaire. La PCR (Polymerase Chain ReactionPolymerase Chain Reaction) est fréquemment utilisée pour amplifier les séquences d'ITS à partir de petits échantillons d'ADN, permettant une analyse détaillée et la constructionconstruction d'arbres phylogénétiquesarbres phylogénétiques. Le séquençageséquençage de nouvelle génération offre également une voie puissante pour analyser les ITS, fournissant des données massivesdonnées massives qui peuvent être utilisées pour de larges études d'évaluation de la diversité et de la structure génétique des populations.
Avantages et défis des ITS comme marqueurs moléculaires
Malgré leur utilité, les ITS présentent certains défis en recherche. Leur haute variabilité peut parfois compliquer l'analyse phylogénétique, particulièrement avec des espèces très similaires. Cela nécessite souvent des analyses complémentaires pour confirmer les résultats. Les ITS restent néanmoins des marqueurs génétiques rapides et précis, ce qui les rend indispensables pour la recherche moderne en génétique et en biologie évolutionnaire.
