Points forts et limites des vaccins à ARN

ARNm : quatre lettres qui ont fait le tour de la planète et désignent ce qui s'avère déjà être une avancée majeure dans le domaine de la vaccination. Mais de quoi parle-t-on exactement ? Les ARN (pour Acides RiboNucléiqueAcides RiboNucléique) sont des moléculesmolécules dont la structure est proche de celle des molécules d'ADN (Acide DésoxyriboNucléiqueAcide DésoxyriboNucléique). Beaucoup moins stables que ces dernières, ce qui signifie qu'elles sont plus facilement détruites, les molécules d'ARN jouent toutefois de nombreux rôles dans les cellules. Ceux-ci varient selon la classe d'ARN considérée : ARN de transfertARN de transfert ou ARN ribosomique qui interviennent dans l'assemblage des protéines, ARN guides qui aident à positionner certaines enzymesenzymes au bon endroit... Aujourd'hui encore, de nouvelles classes d'ARN possédant diverses fonctions biologiques sont découvertes.

L'ARN utilisé pour la vaccination appartient à la classe des ARN messagers (ARNm). Ces petites molécules sont connues depuis les années 1960, époque à laquelle François JacobFrançois Jacob et Jacques MonodJacques Monod, deux éminents scientifiques français, ont joué un rôle prépondérant dans leur découverte. Les ARN messagers sont présents de manière fugace dans nos cellules. Ils constituent en quelque sorte le « plan de montage » des protéines : dans le noyau de la cellule, l'information correspondant à une protéine donnée, portée par l'ADN, est « recopiée » sous forme d'une molécule d'ARNm. Celle-ci passe ensuite dans son cytoplasme (son « corps », soit l'espace compris entre son noyau et sa membrane plasmique). Elle y sera lue par les ribosomesribosomes, les unités chargées de la production des protéines, puis rapidement détruite.

C'est sur cette fonction que reposent les vaccinsvaccins à ARNm. Le principe est en effet d'injecter dans des cellules du tissu musculaire l'information leur permettant de produire une protéine soigneusement sélectionnée et modifiée de l'agent infectieux contre lequel on souhaite obtenir une immunitéimmunité - en l'occurrence la protéine Spike du SARS-CoV-2. Les cellules de l'individu vacciné fabriqueront elles-mêmes transitoirement le constituant viral en question, qui sera reconnu comme étranger à l'organisme et déclenchera une réponse immunitaire spécifique.

Le génome, un mot bien mystérieux. Au-delà de chiffres impressionnants, 23.000 gènes, 3 milliards de nucléotides, comment cette gigantesque bibliothèque abritée dans nos cellules nous permet-elle de produire toutes les protéines dont nous avons besoin ? Film d'animation. Texte : Marion Mathieu (Tous chercheurs) et François Faurisson (Inserm). Illustration et réalisation : Géraldine Fohr. Production : Inserm

Il a longtemps été difficile de travailler avec les molécules d'ARN, en raison de leur fragilité. Mais grâce aux progrès scientifiques, les choses ont changé, et l'on peut aujourd'hui envisager d'utiliser les ARNm comme vaccin.

Avantages et désavantages des vaccins à ARNm ?

Utiliser l'ARNm pour vacciner présente de nombreux avantages. Tout d'abord, c'est une approche vaccinale encore plus sûre dans toutes ses étapes, de la conception à l'utilisation, car aucun être vivant n'est manipulé. La fabrication des vaccins à ARNm est aussi devenue plus « simple » que celles des autres types de vaccins, qu'il s'agisse de vaccins vivants atténués (basés sur l'emploi d'agents infectieux vivants modifiés afin qu'ils perdent leur pouvoir infectieux) ou de vaccins inactivés (qui contiennent des agents infectieux « tués » ou des fragments d'agents infectieux soigneusement purifiés et apprêtés).

La production de ces deux types de vaccins contre des virusvirus nécessite en effet le plus souvent de recourir à des cultures de cellules ou à des œufs embryonnés, dans des conditions très contrôlées. Les vaccins à ARNm s'affranchissent de ces étapes lentes et coûteuses, car ils sont produits par synthèse chimique. En outre, contrairement aux vaccins vivants atténuésatténués, le risque de retour à la virulence est nul, puisqu'ils ne contiennent pas d'agent infectieux mais uniquement l'information nécessaire à la production d'une protéine virale.

Outre le fait que les vaccins à ARNm sont relativement faciles à produire et peu onéreux, leur adaptation à l'évolution des agents pathogènespathogènes peut se faire rapidement. Si de nouveaux variants viraux contre lequel le vaccin serait moins efficace émergentémergent, il suffit (théoriquement !) de modifier la séquence de l'ARNm pour la faire correspondre à celles de ces nouveaux variants viraux afin de retrouver une efficacité optimale.

Enfin, une conséquence de leur présentation originale au système immunitairesystème immunitaire est que les vaccins à ARNm génèrent des réponses immunes larges, incluant les composantes cellulaire (lymphocyteslymphocytes) et humorale (anticorpsanticorps). Or, ces réponses larges sont plus efficaces pour lutter contre les virus.

Les désavantages de ces molécules d'ARNm sont essentiellement liés à leur stabilité plutôt faible. En effet, ce sont des molécules fragiles et leur conservation n'est pas toujours évidente même si des progrès ont été faits ces dernières années (lyophilisation). Que ce soit hors ou dans les cellules, les ARNm disparaissent vite, en raison de leur structure moléculaire...

Un autre désavantage est que lorsque les ARNm sont étrangers à nos cellules, ils peuvent aussi activer des réponses interférons de types 1 et 3 (les interféronsinterférons sont des protéines produites notamment en réaction à des infections virales). Ces réponses mènent finalement à leur dégradation et peuvent réduire l'induction de la réponse immune souhaitée lors de la vaccination. Toutefois l'optimisation des séquences d'ARNm selon diverses approches permet de pallier cet inconvénient.

Peuvent-ils modifier nos génomes ?

Les ARNm des vaccins développés contre la Covid-19Covid-19 ne sont aucunement des organismes génétiquement modifiésorganismes génétiquement modifiés (OGM) et ne constituent pas une approche de thérapie géniquethérapie génique. En effet, ce sont juste de petits morceaux d'acides nucléiquesacides nucléiques inspirés des génomesgénomes viraux, qui n'ont pas la capacité de modifier nos gènesgènes.

Rappelons que les ARNm restent dans le cytoplasme des cellules et n'ont pas vocation à gagner le noyau. Pour pénétrer dans cette partie de la cellule, les molécules présentes dans le cytoplasme doivent être porteuses d'un « étiquettage » spécifique. En outre, des molécules de transport devraient intervenir pour les y emmener. Ce dont ne disposent pas les ARNm des vaccins.

Et quand bien même ces ARNm vaccinaux rentreraient dans le noyau, l'ARN ne peut pas s'intégrer dans notre génome sans être transformé en ADN (on parle de rétrotranscription), ce qui nécessite des enzymes très particulières, appelées transcriptases inverses. Celles-ci sont le plus souvent virales : on les trouve plus particulièrement dans les virus de la famille des RétrovirusRétrovirus (comme le VIH, responsable du Sida) et des Hépadnavirus (comme le virus de l’hépatite B). Des protéines un peu particulières avec une activité transcriptase inversetranscriptase inverse, comme l'ADN polymérasepolymérase eta, ont également été identifiées dans nos cellules. Cependant, ces protéines ne sont pas localisées dans le cytoplasme cellulaire et n'ont pas vocation à interagir avec des ARNm. Une modification de nos génomes par un ARNm relève donc plutôt de la (science)-fiction...

Par ailleurs, il ne suffit pas que la rétrotranscription ait lieu : l'intégration de l'ADN obtenu dans le génome demanderait la présence d'autres enzymes appelées intégrasesintégrases. Et si nous poussons la fiction jusqu'à envisager malgré tout une intégration, celle-ci n'aboutirait pas pour autant à des effets délétères pour la cellule hôte. Il faudrait pour cela que ce fragment s'insère dans une région contenant un gène, or les gènes ne représentent pas la majeure partie de notre génome. De plus, une telle modification ne serait de toute façon pas transmise à la descendance.

Nos cellules sont des espaces très compartimentés. L'ARNm injecté par vaccin ne rentre que dans le corps cellulaire (en bleu pâle), il n'a pas les moyens d'accéder au noyau (en violet). © Torsten Wittmann, Université de California, San Francisco/NIH, CC by-nc

Enfin, il est bon de se rappeler que les ARNm vaccinaux menant à la production de la protéine Spike modifiée lors d'une vaccination sont infiniment moins nombreux que les ARNm produisant la même protéine Spike lors d'une infection naturelle. Dès lors, le risque, si tant est qu'il soit avéré, se situe clairement du côté de l'infection naturelle et non pas de la vaccination.

Pour toutes ces raisons, les « risques » de modification de nos génomes par les ARNm vaccinaux sont pour ainsi dire statistiquement nuls. Nous courrons des risques nettement plus élevés dès lors que nous prenons une aspirineaspirine, notre voiturevoiture ou que nous montons dans un avion... ou que nous nous faisons infecter par le SARS-CoV-2SARS-CoV-2.

Ont-ils été développés trop rapidement ?

Cette remarque revient fréquemment dans les débats récents. Là aussi, il convient de rappeler que la vaccination au moyen d'acides nucléiques, dont les ARNm, est une histoire déjà ancienne (les premières tentatives d'utiliser l'ARNm pour la vaccination remontent au début des années 1990).

De très nombreuses publications précliniques relatives à cette approche chez l'animal (rongeursrongeurs, porcs, bovins et macaques...) ont été publiées et n'ont pas montré d'effets secondaires majeurs à court, moyen et long terme. Par ailleurs, les essais cliniquesessais cliniques chez l'être humain (de phases 1, 2 et 3) ont démontré une excellente efficacité vaccinale et pas plus d’effets secondaires qu'avec les vaccins conventionnels. Signalons au passage que même dans les groupes placebosplacebos (c'est-à-dire dans lesquels aucun principe actifprincipe actif n'a été injecté), des effets secondaires sont rapportés. Cela signifie que lesdits effets secondaires sont en partie liés à l'injection en elle-même.

Nous avons maintenant des centaines de millions de personnes de plus de 12 ans vaccinées sans effets secondaires majeurs. Les vaccins à ARNm protègent contre les formes cliniques graves et réduisent de façon non négligeable la transmission virale en diminuant le nombre de jours d'excrétion du virus chez les quelques personnes néanmoins infectées.

Enfin, en médecine vétérinairevétérinaire, des vaccins à ADN existent depuis quelques années (West-Nile Innovator® contre la maladie de West-Nile chez le cheval, Oncept Canine Melanoma® contre le mélanomemélanome buccalbuccal de chienchien et Clynav® contre la maladie pancréatique du saumonsaumon) et aucun effet indésirable majeur n'a été rapporté.

Quid des phénomènes allergiques observés chez certains patients ?

Des réactions allergiques ont été rapportées chez certains patients suite à la vaccination. Les réactions allergiques post-vaccinales, même si elles sont rares, sont bien connues. Elles sont liées à certains composants des vaccins pour lesquels les patients vaccinés auraient été sensibilisés précédemment (dans leur vie de tous les jours où lors de vaccinations antérieures incluant le même composé).

Face au risque allergique, nous ne sommes en effet pas tous égaux, et notre patrimoine génétiquegénétique joue pour beaucoup. Toute réaction allergique (hypersensibilité de type 1) passe par une phase de sensibilisation à l'antigèneantigène (la substance reconnue comme étrangère par le système immunitaire, qui déclenche la réaction) - la première fois qu'il est rencontré - puis par une phase de latencelatence. Plus tard, confronté à nouveau au même antigène, l'organisme développe la réaction allergique.

En ce qui concerne les allergiesallergies suite à la vaccination contre la Covid-19, celles-ci ont été rapprochées d'une substance, le polyéthylènepolyéthylène glycol, présent à faible dose dans une formulation vaccinale. Cette substance, d'usage courant, a été identifiée comme allergèneallergène dans de rares cas et aurait posé problème chez des personnes à risque allergique avéré ou non identifié. Aux États-Unis et en Europe, où des millions de personnes ont déjà été vaccinées, des réactions allergiques ont effectivement été notées, mais elles restent rares.

Généralement, les personnes à risque se connaissent et pour celle-ci il est convient d'être vigilant avec les vaccins à ARNm, tout comme les vaccins plus conventionnels, mais également avec de simples antibiotiquesantibiotiques (pénicillinepénicilline) ou même des aliments des plus classiques (arachidesarachides, fruits de mer...).

Rapport bénéfice/risque

Un traitement médical n'est jamais un acte anodin et la vaccination ne déroge pas à la règle. Elle doit faire l'objet d'une analyse bénéfice/risque rigoureuse, pour nous-mêmes et pour la collectivité, nationalement et internationalement. Dans le cas de la pandémiepandémie actuelle de Covid-19, il est clair que les effets secondaires associés à l'emploi des vaccins à ARNm sont dans la toute grande majorité des cas temporaires, limités et ne concernent pas tous les patients vaccinés alors que les risques sanitaires, économiques et sociaux de la crise Covid-19 sont de premier plan et pour l'ensemble de la population.

L'emploi de ces nouvelles armes - suivi de près par les acteurs en charge de la pharmacovigilance - s'avère de plus en plus constituer une avancée majeure dans la lutte contre les maladies infectieuses. Et la révolution pourrait ne pas s'arrêter là : en effet, les ARNm pourraient également être utilisés pour lutter contre de nombreux cancerscancers, des maladies orphelines, et même les allergies !