À l'horizon 2050, l'antibiorésistance pourrait causer la mort de millions de personnes, selon les estimations de l'OCDE. Mais, une avancée majeure vient d'être accomplie par les chercheurs du MIT et d'Harvard. Grâce aux outils de l'intelligence artificielle, ils ont découvert une nouvelle molécule qui serait le plus puissant des antibiotiques jamais découvert.
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Les antibiotiques actuellement utilisés sont déjà anciens, et le processus traditionnel pour en découvrir de nouveaux est coûteux et lourd. L'intelligence artificielleintelligence artificielle (IA) permet de rechercher, « in silico », c'est-à-dire par modélisationmodélisation informatique, quelles moléculesmolécules chimiques seraient à même de s'attaquer à certaines bactéries, en faisant examiner des bibliothèques de composés chimiques par l'IA.
« Nous voulions développer une plateforme permettant d'exploiter la puissance de l'intelligence artificielle pour ouvrir une nouvelle ère de découverte de médicaments antibiotiques, explique James Collins, professeur d'ingénierie médicale au Massachusetts Institute of Technology (MIT), coauteur de cette découverte publiée jeudi dans la revue Cell. Notre approche a révélé cette molécule incroyable qui est sans doute l'antibiotique le plus puissant jamais découvert ».
Une percée majeure longtemps attendue
L'IA permet d'élargir le champ des candidats-médicaments à des molécules que les chercheurs ne soupçonnaient pas. L'idée n'est pas nouvelle depuis des décennies, mais jusqu'à présent, les méthodes n'étaient pas assez raffinées pour vraiment trouver des molécules efficaces. Les chercheurs ont entraîné leur modèle à partir de la bactérie Escherichia coli, puis ont recherché parmi une bibliothèque de 6.000 composés chimiques lesquels avaient les caractéristiques recherchées. L'algorithme a trouvé un composé à la structure différente des antibiotiques existants, et prédit qu'il serait efficace contre de nombreuses bactéries.
Ils ont baptisé la molécule « halicin », en hommage à l'ordinateurordinateur HAL du film 2001, l'Odyssée de l'espace, puis l'ont testée en laboratoire contre des dizaines de souches bactériennes prélevées sur des patients et cultivées in vitroin vitro. L'halicine a réussi à tuer de nombreuses bactéries résistantes aux antibiotiques existants, notamment Clostridium difficile, Acinetobacter baumannii, et Mycobacterium tuberculosis. Seule la bactérie Pseudomonas aeruginosa lui a résisté.
Enfin, la nouvelle molécule a été testée sur des souris infectées par A. baumannii, une bactérie qui a infecté de nombreux soldats américains en Irak et en Afghanistan, et qui résiste à tous les antibiotiques existants. Les souris furent guéries en 24 heures.
Les auteurs espèrent que leur modèle permettra de renforcer tout l'arsenal antibiotique, alors que la résistance aux antibiotiques est un sujet d'inquiétude mondiale des autorités sanitaires. L'Organisation de Coopération et de Développement Économiques (OCDEOCDE) a estimé récemment que les bactéries résistantes pourraient tuer 2,4 millions de personnes en Europe, en Amérique du Nord et en Australie d'ici 2050.
par Futura avec l'AFP-Relaxnews
le 24 février 2020
