On peut se demander comment le cormoran de Bougainville parvient à retrouver ses petits dans cette multitude... Les plages et falaises peu accessibles à l'homme accueillent des centaines de milliers de couples, formant ainsi des colonies denses.
Chaque femelle dépose de deux à trois œufs ce qui, en principe devrait faire remonter rapidement les effectifs, mais de nombreux échecs de reproduction peuvent se produire dus à la raréfaction des sources de nourriture qui dépendent essentiellement des caprices d'El NiñoEl Niño lorsque ses eaux chaudes repoussent le courant de Humboldt, tandis que plusieurs dizaines de milliers d'oiseaux sont chassés chaque année pour leur chair dans le nord du Pérou.
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