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La race montbéliarde appartient au rameau jurassiquejurassique (origine Bos Frontosus) d'où dérive le groupe des races pie rouge. Elle fait donc partie de la famille des simmentales et des fleckvieh et de ce fait adhère à la Fédération européenne Pie rouge, dont la montbéliarde a assuré la présidence de 1993 à 1997, et à la Fédération mondiale Pie rouge.
Son histoire remonte au début du XVIIIe siècle lorsque les éleveurs de l'Oberland bernois (Suisse) sont venus s'établir dans la principauté de Montbéliard en amenant avec eux leur cheptel. Ce cheptel, grâce à un travail de sélection méthodique, acquit rapidement une certaine renommée et participa dès 1872 à des concours sous le nom de « race montbéliarde ».
La race montbéliarde officiellement reconnue
En 1889, la montbéliarde est officiellement reconnue et inscrite sur le registre officiel des races françaises par le ministre de l'AgricultureAgriculture.
Le Herd-Book Montbéliard, livre généalogique de la race, est créé la même année et ses statuts sont approuvés par le préfet du Doubs le 2 décembre 1889.
Le contrôle laitier officiel dans la race date de 1923 et ses résultats constituent aujourd'hui un des principaux critères de sélection dans la race. À cette histoire s'ajoutent la tradition fromagère de la région d'origine et l'exigence ancestrale des fromagers pour la matière noble du lait et pour l'absence de mammites.
L'insémination artificielleinsémination artificielle a connu un essor continu depuis ses débuts en 1949 et elle représente un élément déterminant dans l'évolution du cheptel.
Le 28 janvier 1997, l'Unité nationale de promotion et de sélection de la race montbéliarde (UPRA montbéliarde) prend le relais du herd-book. Depuis cette date, l'UPRA montbéliarde constitue l'organisme national responsable de l'orientation et de la sélection de la race.