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Les écosystèmesécosystèmes terrestres sont basés sur des organismes photosynthétiques (végétaux) qui produisent une matière organique riche en composés chimiques très difficile à digérer et à reminéraliser (cellulose, ligninelignine, etc.). Cette matière organique est donc peu consommée par des herbivoresherbivores. Elle constitue des détritus dégradés par un ensemble d'organismes que l'on réunit sous le nom de BAFSH pour BactériesBactéries, ArchéesArchées, Fungi et Straménopiles HétérotrophesHétérotrophes.
Les archées étaient autrefois confondues avec les bactéries. Fungi et straménopiles hétérotrophes font partie d'un vaste ensemble polyphylétiquepolyphylétique (hétérogène) que l'on nommait populairement « champignonschampignons ». BAFSH et détritus sont consommés par les « détritivoresdétritivores ». Le recyclage naturel est lent : plusieurs années, parfois plus de 10 ans. Nous connaissons bien le tapis de feuilles mortes des sous-boisbois forestiers.
Les écosystèmes marins, tout au moins ceux qui sont assez superficiels pour bénéficier de l'énergie lumineuse, sont généralement basés sur des organismes photosynthétiques (« algues rouges », « alguesalgues brunes ») qui produisent une matière organique riche en composés organiques en général faciles à digérer (sauf quand ils sont défendus pas des toxinestoxines) et toujours faciles à reminéraliser (alginates, carraghénanes, etc.) ; cette matière organique est donc largement consommée et son recyclagerecyclage est rapide : quelques semaines à quelques mois.
Principe de l'écosystème posidonie
L'herbier de posidonie est un écosystème unique, en ce sens qu'il juxtapose, qu'il additionne, la matière organique à recyclage lent, la posidonie (plante à fleurs ; boîte 3, Figure 5.1, ci-dessous) et celle à recyclage rapide, les organismes qui vivent sur les rhizomesrhizomes et les feuilles (épibiontes ; boîtes 2 et 4, Figure 5.2).
Au total, la matière organique produite chaque année (la production primaire nette) est considérable et peut se situer au voisinage des records planétaires, terre et mer confondues : entre 2 et 3 kgkg de masse sèche/m²/an ; cette valeur est « nette », c'est-à-dire que l'on en a déduit les pertes, liées par exemple à la respiration et à la production de composés dissous (COD ; boîte 14).
Les feuilles de posidonie, peu consommées, s'accumulent dans la litièrelitière (boîte 8), sont dégradées et fragmentées, en particulier par les détritivores (boîtes 9 à 13) ou bien sont exportées vers d'autres écosystèmes (boîte 24).
Les épibiontes des feuilles (boîte 2), en même temps que la faunefaune de filtreurs et de suspensivores (consommateurs passifs de matière en suspension dans l'eau ; boîte 6), sont activement consommés par des herbivores (boîtes 16 et 17), eux-mêmes consommés par des prédateurs (boîtes 18 et 19).