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Un écotone est une zone de transition écologique entre plusieurs écosystèmes.
Par exemple, une zone estuarienne est un écotone entre l'écosystème marin, l'écosystème fluvial et l'écosystème terrestre.
La variation progressive ou irrégulière des paramètres hydrologiques, pédologiques, ou encore thermiques à la frontière des écosystèmes concernés engendre une mosaïque d'habitats avec une interpénétration des faunes et des flores de ces écosystèmes.
Les écotones abritent donc à la fois des espèces et des communautés des différents milieux qui les bordent, mais aussi des communautés particulières qui leur sont propres. Ces dernières sont en général distribuées sur les zones de transitions physico-chimiques ou microclimatiques (gradientsgradients de salinitésalinité, d'humidité...). Ces zones sont appelées écoclines.
Les écotones sont donc des milieux très riches en biodiversitébiodiversité et, par conséquent, très vulnérables.
