De nombreuses espèces sont déjà menacées de disparaître avant même d'avoir été répertoriées. C'est le cas des vers de terre arboricoles qui viennent d'être découverts en Martinique, nichés au sein de Broméliacées. Ces plantes, massivement importées et commercialisées pour leur aspect décoratif, offrent un habitat opportunément favorable au développement de micro-écosystèmes permettant d'abriter toutes sortes d’organismes, dont ces vers. Les chercheurs ont construit leur propre base de données, disponible en ligne, afin de mieux étudier la biodiversité des vers de terre des régions tropicales.
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Avec l'accélération de la perte de biodiversité, certaines espèces pourraient disparaître avant que les scientifiques n'aient eu le temps de les découvrir et de les décrire, et sans nous laisser le temps de pouvoir agir pour leur conservation. Ce problème est encore plus critique pour les espèces qui vivent dans des habitats improbables et peu étudiés. C'est le cas de certaines espèces de vers de terre qui ne vivent pas dans le sol, comme la majorité de leurs congénères, mais dans les arbres des forêts tropicales et plus particulièrement dans des plantes épiphytes de la famille des Broméliacées.
Cette famille de plantes est spécifique de la zone néotropicale (région couvrant l'Amérique du Sud, l'Amérique centrale et les Caraïbes). Les Broméliacées ont souvent un mode de vie épiphyte, c'est-à-dire qu'elles sont accrochées de manière non parasite aux branches et sur les troncs des grands arbres, grâce à des racines crampon, pour chercher la lumièrelumière de la canopéecanopée. Beaucoup de ces espèces sont menacées par la destruction de leur habitat, notamment la déforestation mais aussi par leur récolte dans les milieux naturels, car ce sont des plantes ornementales.
En Martinique, il existe 24 espèces de Broméliacées, une des plus connues et répandues est Guzmania lingulata, un guide récemment paru permet leur identification. Chez de nombreuses espèces, les feuilles se chevauchent à la base et constituent des réservoirs qui se remplissent d'eau de pluie et de débris végétaux, constituant progressivement un habitat similaire au sol pouvant accueillir toutes sortes d'organismes et formant ainsi un microécosystème où la plante puise ses nutrimentsnutriments grâce à d'autres types de racines (les racines à absorptionabsorption) qui poussent entre ses feuilles. C'est dans ce microhabitat que nous avons découvert des vers de terreterre.
Des vers de terre ont déjà été signalés dans des Broméliacées notamment au Mexique et en Guadeloupe mais, pour le moment ce sont surtout des travaux de taxonomietaxonomie (description des espèces) qui mentionnent leur présence dans ces habitats arboricolesarboricoles. Aucun travail sur l'écologieécologie des vers de Broméliacées n'a été mené, ainsi nous ignorons si les vers sont capables d'y vivre en permanence ou si leur présence y est temporaire. La présence de vers de terre dans cet habitat est probablement beaucoup plus répandue qu'actuellement documentée.
Des vers de terre arboricoles en Martinique
Dans notre étude récemment parue sur la diversité des vers de terre en Martinique, nous avons révélé l'existence de sept espèces différentes de vers de terre vivant presque exclusivement dans les habitats épiphytes de cette île des Petites Antilles. Deux de ces espèces (Dichogaster annae et Dichogaster andina) sont dites exotiquesexotiques, c'est-à-dire natives d'une autre région du monde et introduites en Martinique tandis que les cinq autres espèces étaient à ce jour inconnues, elles sont donc nouvelles pour la science et probablement endémiquesendémiques de Martinique. Nous avons montré que l'abondance de ces cinq espèces était significativement corrélée à la proportion de couverture forestière (quantité de forêt qui couvre une zone géographique particulière) dans cette île volcanique caractérisée par une importante diversité de milieux, avec une forte proportion de zones agricoles au Sud et une région montagneuse au Nord recouverte d'anciennes forêts tropicales humides et dominée par le volcanvolcan de la montagne Pelée.
D'autres espèces ont été trouvées de manière plus opportuniste dans les arbres, alors qu'elles étaient plus fréquemment observées dans d'autres habitats tels que la litièrelitière ou le sol. Cela suggère que ces habitats arboricoles peuvent être colonisés par des vers de terre se déplaçant depuis le sol, confirmant ainsi que la canopée fournit un habitat attrayant pour ces invertébrésinvertébrés. Nos résultats suggèrent donc qu'au cours de leur histoire évolutive, certaines espèces ont fini par occuper presque exclusivement cette niche écologique et ainsi devenir des spécialistes des Broméliacées.
Des espèces nouvelles révélées par la technique de code-barre ADN
La biodiversité des vers de terre des régions tropicales est mal connue et probablement sous-estimée. Cette méconnaissance s'explique par un faible nombre d'études dans ces régions et par une identification des espèces basée sur la morphologiemorphologie particulièrement difficile en raison d'un nombre restreint de caractères diagnostiques externes permettant de les distinguer. Afin de lever cet obstacle taxonomique, la technique de code-barre ADN est particulièrement appropriée. Cette méthode, que nous avons choisie d'utiliser dans notre étude, repose sur la détermination des bases de l'ADNADN (ou séquençageséquençage) d'un court fragment du génomegénome d'un organisme. Cette séquence est ensuite comparée à celles stockées et référencées dans une base de référence.
Cependant, cette base de donnéesbase de données n'est pas toujours disponible, ce qui était le cas dans notre étude. Par conséquent, nous avons construit notre propre base de données de 684 code-barrescode-barres ADN de vers de terre de Martinique disponible en ligne. Les spécimens qui n'ont pas pu être affiliésaffiliés à une espèce connue d'après leurs caractères anatomiques et moléculaires ont été regroupés en unités taxonomiques sur la base de leur ressemblance génétiquegénétique et morphologique. Notre hypothèse est que ces unités taxonomiques correspondent à des espèces nouvelles pour la Science.
Une diversité menacée
Notre étude a permis de montrer que la biodiversité insoupçonnée abritée au sein des Broméliacées épiphytes est principalement menacée par deux types de pressionspressions. L'altération et la fragmentation des habitats naturels notamment liées à l'anthropisation des sols représentent une première menace importante pour cette diversité. En effet, nous avons montré que l'abondance des espèces endémiques des habitats épiphytes était significativement corrélée à la proportion de forêt en Martinique soulignant que les activités humaines, telles que la déforestationdéforestation, en réduisant la taille de l'habitat de ces espèces, peuvent mener à leur extinction.
L'introduction d'espèces exotiques via les activités humaines constitue une autre menace à laquelle sont soumises ces espèces. Dans les régions les plus agricoles de Martinique, nous avons montré l'omniprésence de l'espèce introduiteespèce introduite Dichogaster andina dans les habitats épiphytes. L'absence de diversité génétique parmi 203 séquences obtenues pour cette espèce suggère une reproduction par parthénogénèseparthénogénèse à partir d'un gamètegamète femelle non fécondé, qui est reconnue comme particulièrement avantageuse pour le succès d'une invasion biologique.
Ce résultat met en exergue le risque que des espèces endémiques spécialistes d'un habitat précis (ici les Broméliacées) soient progressivement remplacées par des espèces exotiques envahissantes qui sont généralement plus compétitives dans un contexte de dégradation des habitats.
par Lise Dupont et Mathieu Coulis
le 10 septembre 2023
